Археолошки одсек је почео систематски да се бави истраживањем од 1968. године. Први запослени археолог у Градском музеју у нашем граду била је Љубинка Суботић-Бабовић, од 1970. године. Љубинка Суботић се одмах по доласку прихватила систематизације знања о археолошким траговима које је до тада сакупљено и рекогносцирања обале Тисе, Мртве Тисе и рита где су сконцентрисана насеља, као и обале речице Чик и Бељанске баре. Овако је регистровано скоро 60 локалитета у бечејском атару. Љубинка Суботић-Бабовић је такође учествовала или водила неколико археолошких ископавања код нас која су уједно ила и прва заштитна археолошка ископавања у нашој општини: аварска некропола на локалитету Чик у Бачком Петровом Селу (1968–1973. г. са прекидима), неолитско насеље на локалитету Рибњак код Бачког Градишта (1970. г.) и неолитско насеље на локалитету Виногради (1971).
После њеног одласка, 1973. године у Градском музеју у Бечеју је на месту кустоса-археолога од 1973. до 1975. године радио тада студент археологије Властимир Јанков који ће учествовати на неким ископавањима: старчевачко насеље на локалитету Псеће брдо и аварска некропола на локалитету Перлек, оба 1974. године.
Године 1975. у Градски музеј долази Небојша Станојев. Небојша Станојев руководио је многобројним археолошким радовима на локалитетима од којих ће неки бити систематски праћени више година. Небојша Станојев је наставио рад на ископавању аварске некрополе на локалитету Перлек 1975. године као члан екипе. Следећих година највише се радило на заштитном ископавању локалитета Ботра и Перлек која су дала и највише резултата. Година 1978. године обављено је неколико ископавања на локалитету Ботра (Пречистач отпадних вода), али и ископавање у Пионирској улици. У оквиру истраживања будуће трасе аутопута Нови Сад-Суботица Градски музеј Бечеј радио је на делу трасе код Врбаса. Локалитет Врбас истраживан је и следеће 1979. г. као и локалитет Ботра-Пречистач на коме ће се ископавање обављати и 1981, 1982. и 1983. године. Године 1983. обављено је и заштитно археолошко ископавање локалитета Ботра-Семенска станица. Локалитет Перлек је веома богато налазиште. Како је локација фабрике Carbo-Dioxid изабрана баш на средњoвековном насељу, од те године и надаље ће се пратити сви инвестициони радови у кругу ове фабрике.
Након његовог одласка у Градском музеју у Бечеју ће опет једно време радити Властимир Јанков на месту кустоса археолога од 1980–1983. године. У пом периоду ће учествовати на археолошком ископавању Перлек 1980. и 1981. г.
Године 1984. на радно место кустоса-археолога долази Бранислава Микић Антонић. Локалитети који су ископавани су Перлек (1984, 1988/89, 1994–1995, 2001,2003,2008), Перлек-Бензинска станице (2001,2003), Пионирска улица (1988,2003), Ботра-Зидра (1986–1989), Доње Угарнице (1985), Бељанска бара (1986), лок. Ботра (1994–1995, 2006). Овим ископавањима, на неким локалитетима, настављено је истраживање већ познатих насеља и некропола (Ботра, Перлек, Пионирска улица), док су на неким локалитетима откривена потпуна нова насеља која до тада нису била позната (Ботра-Зидар, Бељанска бара, Доње Угарнице). Истражени су и случајно откривени појединачни гробови (у Бачком Градишту, Бачком Петровом Селу, Зубној амбуланти, Хајдук Вељковој улици, на Старој Бикари).
